PP_0083ANZ.1

Germany/PP_0083ANZ.1/2026-09
A. Brinkmann, C. Kohl, L. Schrick, J. Michel & A. Nitsche

Robert Koch Institute, ZBS1

Sample details

Collection date
2026-09
Sampling location
Germany
Isolate name
MPXV/Germany/2026/ON/RKI1791

Data use terms

Data use terms
OPEN
Data use terms URL

Clade & Lineage

Clade
IIb
Outbreak
sh2017
Lineage
F.4.1

INSDC

INSDC accession
NCBI release date
2026-10-25
NCBI update date
2026-10-25

Host

Host

Submission details

Submission ID
QB200313.1
Submitting group
Date submitted
2026-10-27 21:01:15 UTC
Date released
2026-10-27 21:02:27 UTC
Earliest release date
2026-10-25

Files

Annotations

Alignment and QC

Length
190604 (96.6%)
# of SNPs
99
# of inserted bases
35
# of deleted bases
132
# of unknown bases
289
# of frame shifts
1
Frame shifts
OPG037:34-443(nt:21105-22334)

Nucleotide mutations

Mutations called relative to the NC_063383.1 reference

Substitutions
  • G1262A
  • G2591A
  • G3111A
  • G3522A
  • C3818T
  • C7771T
  • G14000T
  • G15428A
  • A18769G
  • T19282G
  • T19290C
  • C20453T
  • C21309T
  • G21394A
  • G21723A
  • G22541A
  • C23564T
  • G25661A
Deletions
602-609, 22335-22353, 133177-133186, 150586-150602, 169769-169774, 179172-179243
Insertions
ins_136554:ATC, ins_173317:ATATNNATATATATATATATATATATATATAT

Amino acid substitutions

Substitutions called relative to the NC_063383.1 reference

Substitutions

OPG001

  • OPG001:S105L

OPG002

  • OPG002:S54F

OPG003

  • OPG003:D264N

OPG025

  • OPG025:A423D

OPG038

  • OPG038:L207F

OPG047

  • OPG047:R48C

OPG053

  • OPG053:P78S

OPG056

  • OPG056:E125K

OPG057

  • OPG057:E353K

OPG071

  • OPG071:L108F

OPG072

  • OPG072:D56N

OPG074

  • OPG074:D54N
  • OPG074:D393N

OPG092

  • OPG092:D196N

OPG093

  • OPG093:S30L
  • OPG093:D88N

OPG094

  • OPG094:M142I

OPG098

  • OPG098:E162K

OPG105

  • OPG105:S734L

OPG109

  • OPG109:H740Y

OPG113

  • OPG113:H218Y

OPG118

  • OPG118:K606E

OPG121

  • OPG121:E172K

OPG136

  • OPG136:D98N

OPG139

  • OPG139:A17T

OPG145

  • OPG145:E62K
  • OPG145:R243Q
  • OPG145:E435K

OPG148

  • OPG148:G312S

OPG150

  • OPG150:S307L

OPG151

  • OPG151:P664S

OPG164

  • OPG164:E5K
  • OPG164:D97N

OPG175

  • OPG175:S29L

OPG176

  • OPG176:H221Y

OPG193

  • OPG193:L263F

OPG205

  • OPG205:D330N

OPG209

  • OPG209:S30L

OPG210

  • OPG210:D209N
  • OPG210:P722S
  • OPG210:D1604N
  • OPG210:M1741I
Deletions

OPG037

OPG037:28-33

OPG197

OPG197:34, OPG197:35
Insertions

OPG153

ins_OPG153:385:D

Report an issue with this sequence or metadata

Create GitHub issue