PP_00767AN.1

USA/PP_00767AN.1/2026-05
S. Green, H. Barbian, K. Kunstman, S. Bobrovska, E. Newcomer, F. Araujo-Perez, G. Balangue, M. Dominguez, E. Hernandez & J. Kahsen

Regional Innovative Public Health Laboratory, Regional Innovative Public Health Laboratory

Sample details

Collection date
2026-05
Sampling location
USA (IL, Chicago)
Isolate name
hMpxV/USA/IL-RIPHL-MPXV-050-0372/2026

Data use terms

Data use terms
OPEN
Data use terms URL

Clade & Lineage

Clade
IIb
Outbreak
sh2017
Lineage
E.4

INSDC

INSDC accession
NCBI release date
2026-06-30
NCBI update date
2026-06-30

Host

Host

Submission details

Submission ID
PZ526801.1
Submitting group
Date submitted
2026-07-01 04:35:12 UTC
Date released
2026-07-01 04:36:03 UTC
Earliest release date
2026-06-30

Alignment and QC

Length
195579 (97%)
# of SNPs
122
# of inserted bases
46
# of deleted bases
118
# of unknown bases
4297

Nucleotide mutations

Mutations called relative to the NC_063383.1 reference

Substitutions
  • G1262A
  • G2591A
  • G3111A
  • G3522A
  • C3818T
  • C3987T
  • C7008T
  • C7771T
  • G9025A
  • G9229A
  • G10060A
  • G14000T
  • C15771T
  • A18769G
  • C21062T
  • G21723A
  • C22871T
  • G23118A
Deletions
16620-16622, 133177-133186, 174531-174536, 179145-179243
Insertions
ins_133102:TTT, ins_166116:TTAATAA, ins_173304:NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATATATATATATA

Amino acid substitutions

Substitutions called relative to the NC_063383.1 reference

Substitutions

OPG001

  • OPG001:S105L

OPG002

  • OPG002:S54F

OPG003

  • OPG003:D264N

OPG016

  • OPG016:R84K

OPG025

  • OPG025:A423D

OPG036

  • OPG036:M1I

OPG038

  • OPG038:G97S

OPG047

  • OPG047:R48C

OPG053

  • OPG053:P78S

OPG056

  • OPG056:E125K

OPG057

  • OPG057:E353K

OPG061

  • OPG061:H27Y

OPG071

  • OPG071:L108F

OPG072

  • OPG072:D56N

OPG074

  • OPG074:R665C

OPG075

  • OPG075:E62K

OPG077

  • OPG077:D31N

OPG084

  • OPG084:V181I

OPG092

  • OPG092:E155K
  • OPG092:D196N

OPG093

  • OPG093:S30L
  • OPG093:D88N

OPG094

  • OPG094:G4E
  • OPG094:M142I

OPG098

  • OPG098:E162K

OPG102

  • OPG102:T150I

OPG105

  • OPG105:S734L
  • OPG105:E1063K

OPG109

  • OPG109:H740Y

OPG111

  • OPG111:S310L

OPG112

  • OPG112:P70S

OPG114

  • OPG114:D82N

OPG116

  • OPG116:D73N

OPG118

  • OPG118:K606E

OPG124

  • OPG124:L16F

OPG136

  • OPG136:D98N

OPG137

  • OPG137:R107C
  • OPG137:E123K

OPG139

  • OPG139:A17T

OPG145

  • OPG145:E62K
  • OPG145:R243Q
  • OPG145:E435K

OPG150

  • OPG150:T126A

OPG153

  • OPG153:E293Q

OPG172

  • OPG172:I178V

OPG176

  • OPG176:S52L
  • OPG176:E196K
  • OPG176:H221Y

OPG180

  • OPG180:D59N

OPG188

  • OPG188:E202K

OPG193

  • OPG193:L263F

OPG209

  • OPG209:T131S

OPG210

  • OPG210:D209N
  • OPG210:D427N
  • OPG210:P722S
  • OPG210:M1741I
Deletions

OPG029

OPG029:154
Insertions
N/A

Report an issue with this sequence or metadata

Create GitHub issue