PP_007679Q.1

USA/PP_007679Q.1/2026-05
S. Green, H. Barbian, K. Kunstman, S. Bobrovska, E. Newcomer, F. Araujo-Perez, G. Balangue, M. Dominguez, E. Hernandez & J. Kahsen

Regional Innovative Public Health Laboratory, Regional Innovative Public Health Laboratory

Sample details

Collection date
2026-05
Sampling location
USA (IL, Chicago)
Isolate name
hMpxV/USA/IL-RIPHL-MPXV-050-0371/2026

Data use terms

Data use terms
OPEN
Data use terms URL

Clade & Lineage

Clade
IIb
Outbreak
sh2017
Lineage
F.4.1

INSDC

INSDC accession
NCBI release date
2026-06-30
NCBI update date
2026-06-30

Host

Host

Submission details

Submission ID
PZ526800.1
Submitting group
Date submitted
2026-07-01 04:35:12 UTC
Date released
2026-07-01 04:36:03 UTC
Earliest release date
2026-06-30

Alignment and QC

Length
195588 (97%)
# of SNPs
116
# of inserted bases
39
# of deleted bases
112
# of unknown bases
4283

Nucleotide mutations

Mutations called relative to the NC_063383.1 reference

Substitutions
  • G1262A
  • G2591A
  • G3111A
  • G3522A
  • C3740T
  • C3818T
  • C7771T
  • G14000T
  • A18769G
  • C20265T
  • C20453T
  • G20576A
  • G21394A
  • G21723A
  • G21751A
  • C23564T
  • G24205A
  • G25661A
Deletions
133177-133186, 136552-136554, 179145-179243
Insertions
ins_133102:TTT, ins_173304:NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATATATATATA

Amino acid substitutions

Substitutions called relative to the NC_063383.1 reference

Substitutions

OPG001

  • OPG001:S105L

OPG002

  • OPG002:S54F

OPG003

  • OPG003:D264N
  • OPG003:E290K

OPG025

  • OPG025:A423D

OPG035

  • OPG035:R47K

OPG037

  • OPG037:S228L
  • OPG037:S347F

OPG043

  • OPG043:P163S

OPG047

  • OPG047:R48C

OPG053

  • OPG053:P78S

OPG055

  • OPG055:S278L

OPG056

  • OPG056:E125K

OPG057

  • OPG057:E353K

OPG065

  • OPG065:R28C

OPG068

  • OPG068:E75K
  • OPG068:E108K

OPG071

  • OPG071:L108F

OPG072

  • OPG072:D56N

OPG092

  • OPG092:D196N

OPG093

  • OPG093:S30L
  • OPG093:D88N

OPG094

  • OPG094:M142I

OPG097

  • OPG097:R181K

OPG098

  • OPG098:E162K

OPG105

  • OPG105:S734L

OPG109

  • OPG109:H740Y

OPG113

  • OPG113:H218Y

OPG118

  • OPG118:S521F
  • OPG118:K606E

OPG122

  • OPG122:R182Q

OPG136

  • OPG136:D98N

OPG139

  • OPG139:A17T

OPG145

  • OPG145:E62K
  • OPG145:R243Q
  • OPG145:E435K

OPG148

  • OPG148:E157K
  • OPG148:G312S

OPG163

  • OPG163:P67S

OPG170

  • OPG170:R51K

OPG175

  • OPG175:S29L

OPG176

  • OPG176:D128N
  • OPG176:H221Y

OPG190

  • OPG190:E129K

OPG193

  • OPG193:L263F

OPG198

  • OPG198:S179L

OPG205

  • OPG205:D330N

OPG209

  • OPG209:S30L

OPG210

  • OPG210:D209N
  • OPG210:P722S
  • OPG210:M1741I
Deletions

OPG153

OPG153:385
Insertions
N/A

Report an issue with this sequence or metadata

Create GitHub issue