PP_006TNCV.1

USA/PP_006TNCV.1/2026-01
S. Green, K. Kunstman, H. Barbian, F. Araujo Perez, A. Kittner, S. Bobrovska & E. Newcomer

Rush University Medical Center, Regional Innovative Public Health Laboratory (RIPHL)

Sample details

Collection date
2026-01
Sampling location
USA (IL, Chicago)
Isolate name
hMpxV/USA/IL-RIPHL-050-0364/2025

Data use terms

Data use terms
OPEN

Data use terms history

ChangedUserData use terms
2026-04-06 13:03insdc_ingest_userOPEN
Data use terms URL

Clade & Lineage

Clade
IIb
Outbreak
sh2017
Lineage
F.2

INSDC

INSDC accession
NCBI release date
2026-04-05
NCBI update date
2026-04-05

Host

Host

Submission details

Submission ID
PZ221716.1
Submitting group
Date submitted
2026-04-06 13:03:31 UTC
Date released
2026-04-06 13:12:40 UTC
Earliest release date
2026-04-05

Alignment and QC

Length
195588 (94.5%)
# of SNPs
93
# of inserted bases
44
# of deleted bases
109
# of unknown bases
9305

Nucleotide mutations

Mutations called relative to the NC_063383.1 reference

Substitutions

  • C882T
  • G1262A
  • G2591A
  • G3111A
  • G3522A
  • C3818T
  • C7771T
  • G12690A
  • G14000T
  • A18769G
  • C20453T
  • G21723A
  • C22167T
  • G23474A
  • C23564T
  • G25213A
  • G25661A
  • C27826T
Deletions

133177-133186, 179145-179243
Insertions

ins_133102:TTT, ins_136554:ATC, ins_150584:N, ins_165053:A, ins_173297:NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

Amino acid substitutions

Substitutions called relative to the NC_063383.1 reference

Substitutions

OPG001

  • OPG001:S105L
  • OPG001:D232N

OPG002

  • OPG002:S54F

OPG003

  • OPG003:D264N

OPG023

  • OPG023:P71S

OPG025

  • OPG025:A423D

OPG040

  • OPG040:S89F

OPG043

  • OPG043:E44K

OPG047

  • OPG047:R48C

OPG053

  • OPG053:P78S

OPG056

  • OPG056:E125K

OPG057

  • OPG057:E353K

OPG066

  • OPG066:S11L

OPG071

  • OPG071:L108F
  • OPG071:D383N

OPG072

  • OPG072:D56N

OPG091

  • OPG091:A89V

OPG092

  • OPG092:D196N

OPG093

  • OPG093:S30L
  • OPG093:D88N

OPG094

  • OPG094:M142I

OPG098

  • OPG098:E162K

OPG105

  • OPG105:S734L

OPG109

  • OPG109:H740Y

OPG118

  • OPG118:K606E

OPG120

  • OPG120:D151N

OPG136

  • OPG136:D98N

OPG139

  • OPG139:A17T

OPG145

  • OPG145:E62K
  • OPG145:R243Q
  • OPG145:E435K

OPG176

  • OPG176:H221Y

OPG188

  • OPG188:E12K

OPG193

  • OPG193:L263F

OPG210

  • OPG210:P722S
  • OPG210:M1741I
Deletions
N/A
Insertions

OPG153

ins_OPG153:385:D

Report an issue with this sequence or metadata

Create GitHub issue