Pathoplexus
Organisms
Mpox Virus
SeqSets
News
About
Docs
Login
Pathoplexus
Organisms
Crimean-Congo Hemorrhagic Fever Virus
Ebola Sudan
Ebola Zaire
HMPV
Measles Virus
Mpox Virus
RSV-A
RSV-B
West Nile Virus
SeqSets
News
About
Docs
Login
API docs
Governance
Funding
Contact
Status
Mpox Virus
|
Browse data
Submit sequences
PP_004BJKK.1
Download
Download FASTA
Download metadata TSV
Restricted-Use sequence
This sequence is only available under the
Restricted Use Terms
. This prohibits publications that use this sequence as focal data during the restricted-use period, except with the consent of the sequence submitters.
Display Name: Democratic_Republic_of_the_Congo/PP_004BJKK.1/2025-06-14
Tony Wawina-Bokalanga,
Adrienne Amuri-Aziza,
Placide Mbala-Kingebeni,
Eddy Kinganda-Lusamaki,
Elisabeth Pukuta-Simbu,
Emmanuel Hasivirwe-Vakaniaki,
Rilia Ola-Mpumbe,
Papy Kwete-Mbokama,
Prince Akil-Bandali,
Cris Kacita,
Ange Ponga-Museme,
Nelson Mapenzi-Kashali,
Gloria Vakaniaki,
Kelly-Michel Kenye,
Elisabeth Muyamuna,
Sifa Kavira-Bapitani,
Patrick Mukadi,
Aine OToole,
Olivier Tshiani-Mbaya,
Princesse Paku-Tshambu,
Emmanuel Lokilo-Lofiko,
Chloe Muswamba-Kayembe,
Jean-Claude Makangara-Cigolo,
Fiston Cikaya-Kankolongo,
...,
Jean-Jacques Muyembe-Tamfum
Show more
Sample details
Collection date
2025-06-14
Country
Democratic Republic of the Congo
Admin level 1
Kinshasa
Data use terms
Data use terms
RESTRICTED
✕
Data use terms history
Changed
User
Data use terms
2025-10-21 09:28
grathos
RESTRICTED until 2026-10-21
Close
(history)
Data use terms URL
https://pathoplexus.org/about/terms-of-use/restricted-data
Clade & Lineage
Clade
Ia
Outbreak
None
Lineage
None
Authors
Author affiliations
Institut National de Recherche Biomédicale
Alignment and QC metrics
Length
187438
Completeness
52.95%
# of SNPs
470
# of inserted bases
2678
# of deleted bases
3007
# of ambiguous bases
0
# of unknown bases
83350
# of frame shifts
3
# of stop codons
0
Frame shifts
OPG164:229(nt:143460-143464),OPG180:556-560(nt:154356-154371),OPG191:167-169(nt:166658-166667)
Submission details
Submission ID
25MPX6051V
Submitting group
Pathogen Genomic Lab
Date submitted
2025-10-21 09:27:59 UTC
Date released
2025-10-21 09:36:46 UTC
Earliest release date
2025-10-21
Nucleotide mutations
Mutations called relative to the
NC_063383.1
reference
Substitutions
T
466
C
G
475
A
C
630
A
T
720
C
G
749
A
G
907
A
G
994
A
A
1093
G
C
1201
T
A
1309
G
G
1319
T
A
1504
G
A
1687
G
A
1813
C
T
1814
G
T
2086
G
C
2391
A
T
2554
C
Show more
Deletions
458-460, 600-609, 2239-2241, 4842-4923, 6432, 6433, 7021-7026, 7148-7151, 7405, 8055, 13276, 13353, 15833, 15834, 15872, 16608-16613, 18055-18057, 29745-29753, 32210-32212, 34051, 34052, 40705, 41935, 46506-46508, 46596, 47576, 47700, 47701, 48166-48168, 50589-50606, 132813, 133088-133102, 133177-133186, 133493-133945, 139429-139431, 142777, 143459, 144341, 150539, 150568, 150634,...
Show more
Insertions
ins_631:GAGAGAA, ins_755:ACA, ins_1374:GGATACCTCATCATCTTC, ins_6256:TT, ins_6527:T, ins_6975:GTATAATCATCACTGTCGCTATCATTAT, ins_6983:T, ins_7435:GTA, ins_10476:NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN, ins_13297:TAGTTTCTATTTTTA, ins_16407:GTGT, ins_19132:NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN...
Show more
Amino acid mutations
Mutations called relative to the
NC_063383.1
reference
Substitutions
OPG001
OPG001:
T
86
N
OPG002
OPG002:
A
121
S
OPG002:
N
313
T
OPG015
OPG015:
V
4
A
OPG015:
L
136
F
OPG019
OPG019:
M
124
R
OPG023
OPG023:
A
90
V
OPG023:
M
109
I
OPG023:
V
174
A
OPG023:
A
193
S
OPG023:
S
258
L
OPG023:
Y
300
H
OPG023:
C
304
R
OPG023:
V
426
T
OPG023:
T
488
A
OPG023:
L
602
I
OPG023:
K
637
E
OPG024
OPG024:
S
32
G
OPG027
OPG027:
I
47
V
OPG027:
F
79
L
OPG027:
V
126
I
OPG029
OPG029:
C
146
R
OPG030
OPG030:
N
12
D
OPG030:
S
113
N
OPG031
OPG031:
T
80
M
OPG031:
D
117
E
OPG031:
C
241
Y
OPG031:
M
271
K
OPG034
OPG034:
L
205
R
OPG036
OPG036:
S
11
P
OPG036:
D
25
E
OPG037
OPG037:
C
415
R
OPG040
OPG040:
P
254
A
OPG047
OPG047:
I
232
K
OPG049
OPG049:
E
235
K
OPG049:
T
263
M
OPG056
OPG056:
V
323
A
OPG056:
T
602
N
OPG056:
C
622
Y
OPG063
OPG063:
V
307
A
OPG065
OPG065:
A
17
T
OPG065:
N
23
D
OPG065:
H
61
N
OPG066
OPG066:
K
83
R
OPG066:
H
97
N
OPG071
OPG071:
L
411
W
OPG071:
I
428
T
OPG071:
A
484
S
OPG071:
I
501
V
OPG076
OPG076:
S
20
N
OPG079
OPG079:
C
45
Y
OPG085
OPG085:
S
79
T
OPG085:
T
328
A
OPG094
OPG094:
Q
136
R
OPG094:
R
175
T
OPG100
OPG100:
K
152
Q
OPG101
OPG101:
T
153
A
OPG102
OPG102:
I
249
V
OPG104
OPG104:
T
12
A
OPG105
OPG105:
I
1070
V
OPG111
OPG111:
I
77
V
OPG112
OPG112:
H
34
R
OPG118
OPG118:
V
462
A
OPG118:
K
606
E
OPG119
OPG119:
T
88
R
OPG120
OPG120:
A
19
T
OPG120:
H
213
R
OPG125
OPG125:
E
111
D
OPG125:
I
514
V
OPG130
OPG130:
T
63
V
OPG130:
T
122
A
OPG130:
L
270
I
OPG134
OPG134:
V
19
A
OPG134:
E
226
D
OPG135
OPG135:
V
90
E
OPG144
OPG144:
M
41
I
OPG144:
T
184
I
OPG148
OPG148:
I
313
S
OPG148:
A
329
S
OPG150
OPG150:
N
100
D
OPG150:
D
256
E
OPG151
OPG151:
D
6
V
OPG154
OPG154:
R
74
H
OPG154:
H
107
R
OPG156
OPG156:
Y
42
S
OPG156:
T
222
A
OPG156:
I
261
M
OPG157
OPG157:
M
24
V
OPG159
OPG159:
T
2
A
OPG159:
L
36
S
OPG164
OPG164:
I
111
V
OPG164:
Y
217
H
OPG165
OPG165:
S
39
T
OPG165:
D
106
N
OPG165:
S
161
L
OPG167
OPG167:
Y
107
S
OPG167:
I
112
V
OPG176
OPG176:
D
24
N
OPG176:
L
227
S
OPG181
OPG181:
L
85
M
OPG181:
S
127
Y
OPG187
OPG187:
K
300
*
OPG188
OPG188:
V
265
I
OPG188:
S
419
R
OPG189
OPG189:
K
185
R
OPG192
OPG192:
G
100
E
OPG193
OPG193:
I
108
R
OPG195
OPG195:
C
120
S
OPG199
OPG199:
K
230
E
OPG199:
V
304
M
OPG200
OPG200:
D
52
G
OPG200:
E
134
G
OPG205
OPG205:
C
349
Y
OPG205:
G
354
S
OPG205:
V
621
A
OPG205:
V
690
A
OPG205:
R
733
Q
OPG208
OPG208:
A
34
V
OPG210
OPG210:
V
173
I
OPG210:
K
331
N
OPG210:
N
334
I
OPG210:
H
363
R
OPG210:
D
379
G
OPG210:
V
515
A
OPG210:
S
781
P
OPG210:
V
788
A
OPG210:
T
928
A
OPG210:
L
1704
R
OPG210:
D
1717
G
OPG210:
E
1863
D
Deletions
OPG002:172, OPG029:153, OPG029:154, OPG031:258, OPG049:314, OPG157:61, OPG164:228, OPG180:555, OPG191:166, OPG210:734
Insertions
ins_OPG001:74:DDEVSE, ins_OPG110:79:EEV, ins_OPG164:212:*, ins_OPG205:736:QS
Load sequences
Report an issue with this sequence or metadata
Create GitHub issue