PP_0015HNV.1

Germany/PP_0015HNV.1/2025-03
A. Brinkmann, C. Kohl, L. Schrick, J. Michel, L. Schaade & A. Nitsche

Robert Koch Institute, Centre for Biological Threats, Highly Pathogenic Viruses

Sample details

Collection date
2025-03
Sampling location
Germany
Isolate name
MPXV/Germany/2025/ON/RKI1281

Data use terms

Data use terms
OPEN

Data use terms history

ChangedUserData use terms
2025-04-23 03:26insdc_ingest_userOPEN
Data use terms URL

Clade & Lineage

Clade
IIb
Outbreak
sh2017
Lineage
F.4.1

INSDC

INSDC accession
NCBI release date
2025-04-22
NCBI update date
2025-04-22

Host

Host

Submission details

Submission ID
PV535603.1
Submitting group
Date submitted
2025-04-23 03:26:25 UTC
Date released
2025-04-23 03:27:11 UTC
Earliest release date
2025-04-22

Alignment and QC

Length
190627 (95.9%)
# of SNPs
88
# of inserted bases
20
# of deleted bases
90
# of unknown bases
1562

Nucleotide mutations

Mutations called relative to the NC_063383.1 reference

Substitutions

  • G1262A
  • C1785T
  • G2591A
  • G3111A
  • G3522A
  • C3818T
  • C7771T
  • G14000T
  • G15428A
  • A18769G
  • C19451T
  • C20453T
  • G21394A
  • G21723A
  • C23389T
  • C23564T
  • G25661A
  • T28175C
Deletions

607-609, 133177-133186, 150551, 150562-150565, 179196-179267
Insertions

ins_133134:NN, ins_173317:ATATATATATATATATAT

Amino acid substitutions

Substitutions called relative to the NC_063383.1 reference

Substitutions

OPG001

  • OPG001:S105L

OPG002

  • OPG002:S54F
  • OPG002:V323I

OPG003

  • OPG003:D264N

OPG025

  • OPG025:A423D

OPG037

  • OPG037:S347F

OPG039

  • OPG039:E244K

OPG047

  • OPG047:R48C

OPG053

  • OPG053:P78S

OPG056

  • OPG056:E125K

OPG057

  • OPG057:E353K

OPG064

  • OPG064:S698F

OPG071

  • OPG071:L108F

OPG072

  • OPG072:D56N

OPG074

  • OPG074:D54N

OPG092

  • OPG092:D196N

OPG093

  • OPG093:S30L
  • OPG093:D88N

OPG094

  • OPG094:M142I

OPG098

  • OPG098:E162K

OPG105

  • OPG105:S734L

OPG109

  • OPG109:H740Y

OPG113

  • OPG113:H218Y

OPG118

  • OPG118:K606E

OPG121

  • OPG121:E172K

OPG136

  • OPG136:D98N

OPG139

  • OPG139:A17T

OPG145

  • OPG145:E62K
  • OPG145:R243Q
  • OPG145:E435K

OPG148

  • OPG148:G312S

OPG150

  • OPG150:S307L

OPG175

  • OPG175:S29L

OPG176

  • OPG176:H221Y

OPG193

  • OPG193:L263F

OPG205

  • OPG205:D330N
  • OPG205:R537Q

OPG209

  • OPG209:S30L

OPG210

  • OPG210:D209N
  • OPG210:P722S
  • OPG210:M1741I
Deletions
N/A
Insertions
N/A

Report an issue with this sequence or metadata

Create GitHub issue