PP_001450L.1

Germany/PP_001450L.1/2025-01
A. Brinkmann, C. Kohl, L. Schrick, J. Michel, L. Schaade & A. Nitsche

Robert Koch Institute, Centre for Biological Threats, Highly Pathogenic Viruses

Sample details

Collection date
2025-01
Sampling location
Germany
Isolate name
MPXV/Germany/2025/ON/RKI1244

Data use terms

Data use terms
OPEN

Data use terms history

ChangedUserData use terms
2025-02-25 22:36insdc_ingest_userOPEN
Data use terms URL

Clade & Lineage

Clade
IIb
Outbreak
sh2017
Lineage
E.1.1

INSDC

INSDC accession
NCBI release date
2025-02-25
NCBI update date
2025-02-25

Host

Host

Submission details

Submission ID
PV173509.1
Submitting group
Date submitted
2025-02-25 22:36:53 UTC
Date released
2025-02-25 22:37:04 UTC
Earliest release date
2025-02-25

Alignment and QC

Length
190628 (96.3%)
# of SNPs
94
# of inserted bases
21
# of deleted bases
90
# of unknown bases
731

Nucleotide mutations

Mutations called relative to the NC_063383.1 reference

Substitutions

  • G1262A
  • G2591A
  • G3111A
  • G3522A
  • C3818T
  • C7771T
  • G9229A
  • G12285A
  • G13563A
  • G14000T
  • G15428A
  • A18769G
  • C21062T
  • G21723A
  • G23110A
  • C23564T
  • G25661A
  • T28175C
Deletions

606-609, 133177-133186, 150564-150567, 179172-179243
Insertions

ins_133134:NN, ins_157311:T, ins_173308:AATATATATATATATATA

Amino acid mutations

Mutations called relative to the NC_063383.1 reference

Substitutions

OPG001

  • OPG001:S105L

OPG002

  • OPG002:S54F

OPG003

  • OPG003:D264N

OPG016

  • OPG016:R84K

OPG023

  • OPG023:R206C

OPG025

  • OPG025:A423D
  • OPG025:P569S

OPG036

  • OPG036:M1I

OPG038

  • OPG038:S17L

OPG047

  • OPG047:R48C

OPG053

  • OPG053:P78S

OPG056

  • OPG056:E125K

OPG057

  • OPG057:E353K

OPG071

  • OPG071:L108F

OPG072

  • OPG072:D56N

OPG074

  • OPG074:R665C

OPG092

  • OPG092:D196N

OPG093

  • OPG093:S30L
  • OPG093:D88N

OPG094

  • OPG094:M142I

OPG098

  • OPG098:E162K

OPG105

  • OPG105:S734L

OPG109

  • OPG109:H740Y

OPG118

  • OPG118:K606E

OPG124

  • OPG124:L16F

OPG136

  • OPG136:D98N

OPG139

  • OPG139:A17T

OPG145

  • OPG145:E62K
  • OPG145:R243Q
  • OPG145:E435K

OPG150

  • OPG150:S307L

OPG164

  • OPG164:D67N

OPG176

  • OPG176:S52L
  • OPG176:H221Y

OPG180

  • OPG180:D59N

OPG181

  • OPG181:D218N

OPG185

  • OPG185:T258I

OPG188

  • OPG188:E229K

OPG189

  • OPG189:R179K

OPG193

  • OPG193:L263F

OPG210

  • OPG210:D209N
  • OPG210:P722S
  • OPG210:S1488L
  • OPG210:M1741I
Deletions
N/A
Insertions
N/A

Report an issue with this sequence or metadata

Create GitHub issue